Métodos de Correlación Estructura-Actividad aplicados a efectos adversos de fármacos con aplicación en el sistema digestivo, Cuenca, 2019

Abstract

El método QSAR relaciona un efecto biológico y una estructura molecular, se utiliza en el presente estudio como un predictor en base a un modelo matemático para fármacos de aplicación en el sistema digestivo. La base de datos fue extraída de SIDER 4.1 Side Effects Resource, usando como fuente para los cálculos la frecuencia de los efectos secundarios los ponderamos como leves (1), intermedios (5) más graves (10). Se trabajó con 91 moléculas activas. Calculamos descriptores moleculares con DRAGON. Se obtuvo 2 clases de respuestas: Clase 1: pocos efectos secundarios, clase 2: grandes efectos secundarios. Para establecer un umbral óptimo se utilizó N.E.R. y aplicamos el método toolbox de MATLAB, con lo que se realizó dos conjuntos de training set y test set de validación externa, con lo cual se calcula sensibilidad, especificidad y precisión. Posteriormente se aplicó un algoritmo SIMPLEX obteniendo el punto de partición 4 con los respectivos valores de umbral: 0.0035, N.E.R: 0.632, Sp: 0.572 Sn: 0.692 Pr: 0.6 Número de descriptores: 3. Con la selección de los 3 descriptores obtenemos el modelo predictor para la clase 1: Sp: 0.6969697, Sn: 0.70967742, Pr: 0.6875, Clase 2: Sp: 0.70967742, Sn: 0.6969697, Pr: 0.71875. Para validación externa en la clase 2: Sp: 0.572, Sn: 0.692, Pr: 0.6, N.E.R: 0.632. Se proporciona con el modelo una herramienta de predicción útil para definir en fase de planificación pre síntesis de un fármaco.