Comparación de métodos de extracción de ADN para la identificación de la microbiota bacteriana presente en los caparazones de las tortugas de Galápagos (Chelonoidis Spp.) En las islas Santa Cruz e Isabela

Abstract

Los caparazones de las tortugas gigantes están siempre expuestos, el cual puede afectarlos a través de la exposición a bacterias, hongos y otros organismos presentes en el entorno. El microbioma asociado a los caparazones de las tortugas gigantes de Galápagos (Chelonoidis spp) no ha sido caracterizado hasta la fecha. Para ello, es necesario establecer ciertos parámetros que permitan la extracción de ADN de los microorganismos que puedan encontrarse en dichos caparazones. El objetivo de este estudio consistió en encontrar la metodología óptima parala extracción de ADN de bacterias utilizando muestras de raspados de caparazón de tres especies de tortugas gigantes de Galápagos. Encontramos que el pretratamiento utilizando esferas de cristal e incubación y el kit DNEasy PowerSoil Pro Kit de Qiagen fueron los más óptimos para este tipo de muestra, dando como resultado una gran riqueza de géneros bacterianos en cada una de las muestras secuenciadas.